Большое внимание уделяется науке. Ученые института занимаются исследованиями в области истории, археологии и этнокультуры каракалпакского народа ,  его устного и письменного наследия; изучают причины возникновения аральской проблемы  и разрабатывают научные методы, направленные на улучшение экологической ситуации в регионе, сохранение его флоры и фауны.

       В институте имеются все необходимые условия для подготовки педагогов новой формации:

       - квалифицированный профессорско-преподавательский состав, в который входят 1 академик; 17 докторов наук и профессоров, 107 кандидатов  наук и доцентов. Среди них- обладатели государственных грантов,   заслуженные деятели науки и народного образования, лауреаты государственных премий, отличники народного образования и профессионалы,  награжденные орденами и медалями за доблестный труд в области образования;

       - материально-техническая база, отвечающая современным требованиям; научные и учебные лаборатории, Интернет-классы, лингафонные кабинеты, мультимедийная техника, информационно-ресурсный центр, регулярно обновляемый библиотечный фонд, спортивные комплексы, хорошо оснащённые столовые и студенческое общежитие;

      Студенты Нукусского пединститута - победители республиканских олимпиад по каракалпакскому и казахскому языку и литературе,  обладатели Президентской стипендии и государственных стипендии имени Улугбека, Навои и Берунии,  лауреаты международной стипендии имени Менделеева, стипендий «Келажак овози», призеры суперлиги КВН, чемпионы Универсиады и различных турниров по волейболу, чемпионы   Республики Каракалпакстан по футболу. Женская команда НГПИ по волейболу участвует в высшей лиге Республики  Узбекистан. Самодеятельный студенческий ансамбль института «Тумарис» ежегодно принимает участие в праздновании всенародных праздников «Навруз» и «День  Независимости» в столицах наших республик  городах Нукусе и Ташкенте.